De stichting Gods Gemeente Ezechiël wordt bestuurd door de Voorzitter (dhr. T.R.F. van Heijdoorn, Pastor), een Bestuurslid (mw.  M.E. Chotkan – Watamaleo, Diaken en de Penningmeester, dhr. Drs. D.I. Bacchus.

Het Bestuur ontvangt geen vergoeding en is dus onbezoldigd. Behoudens onkosten vergoeding voor gemaakte onkosten zoals reiskosten. Slechts gerealiseerde onkosten worden op vertoon van bonnen en facturen vergoed.